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Détail de l'offre: Brain long-distance connectivity extraction from DICOM images


  • Société: Dassault Systemes
  • Secteur d'Activité: Informatique, Electronique et Télécom
  • Région du poste: France: Ile de France
  • Type de poste: Brain long-distance connectivity extraction from DICOM images
  • Contrat: Sans Précision
  • Formation:
  • Lieu de travail: Paris
  • Date d'embauche: NC
  • Salaire: N/A
  • Référence: NC


Description du Poste:

Team Introduction and Overview : Dassault Systèmes, « The 3DEXPERIENCE Company », offre aux entreprises et aux particuliers les univers virtuels nécessaires à la conception d’innovations durables. Ses solutions leaders sur le marché transforment pour ses clients, la conception, la fabrication et la maintenance de leurs produits. Les solutions collaboratives de Dassault Systèmes permettent de promouvoir l’innovation sociale et offrent de nouvelles possibilités d’améliorer le monde  réel grâce aux univers virtuels. Avec des ventes dans plus de 140 pays, le Groupe apporte de la valeur à plus de 190 000 entreprises de toutes tailles dans toutes les industries. Pour plus d’informations : www.3ds.com.L'organisation 'BioSphere Research' de Dassault Systèmes réalise une veille scientifique et technologique permanente et réalise des prototypes logiciels pour évaluer l'applicabilité de nouvelles technologies et ou connaissances scientifiques.Ce service doit assurer à tout moment un haut niveau de compétences dans tous les domaines technologiques, biologiques et biomédicaux de l'entreprise, et doit préparer ses éventuelles diversifications et acquisitions. Role and Purpose : Les images issues des appareils d’IRM (Imagerie par résonance magnétique) sont des images volumiques qui donnent des indications sur les différents tissus, organes ou sous-organes par des représentations en niveaux de gris. Pour certaines analyses plus fines, il peut être utile d’extraire des informations comme des tractographies, la trajectoire de faisceaux de fibres dans la matière blanche qui connectent les aires cérébrables entre elles. Les laboratoires réalisent pour cela des examens dits de Diffusion Tensor Imaging.Dans le cadre de ce stage, le stagiaire recensera les algorithmes existants de tractographie. Puis le stagiaire réalisera l’implémentation logicielle d’un ou plusieurs de ces algorithmes sur architecture classique (PC). Enfin, le composant résultant de ce développement logiciel sera intégré à une infrastructure de workflow existante, de manière à alimenter les analyses situées en aval.Références:Le Bihan, D., Mangin, J.-F., Poupon, C., Clark, C. A., Pappata, S., Molko, N. and Chabriat, H. (2001), Diffusion tensor imaging: Concepts and applications. J. Magn. Reson. Imaging, 13: 534–546. doi:10.1002/jmri.1076.Mori, S., & van Zijl, P. (2002). Fiber tracking: principles and strategies–a technical review. NMR in Biomedicine, 15(7âu20acu00908), 468-480. Technical Competencies needed : Etudiant(e) en Ecole d'Ingénieurs et/ou Master universitaire, vous préparez un diplôme de niveau Bac+5.Vous vous spécialisez en Développement Logiciel et/ou Traitement d’images 3D et/ou Analyse mathématique et géométrique et/ou Neuro-anatomie Computationnelle.Compétences techniques requises- Bon niveau de programmation Python ou C/C++- Modélisation géométrique 3D (Bézier, Mesh 3D…)- Connaissances en traitement d’images médicales (format DICOM, DTI...)- Connaissances en algorithmes de tractographie.Compétences techniques souhaitéesVotre candidature aura un atout supplémentaire, si vous disposez de :- Exposition antérieure au logiciel diffusion toolkits : FSL, MRTrix….- Exposition antérieure à des algorithmes d’extraction de trajectoires à partir de DTI.- Notions programmation Web, en particulier WebGL. Personal Competencies needed : - Créativité et esprit collaboratif dans l’échange d’idées avec les autres membres du département BioSphere Research.- Autonomie et force de propositions pour la mise en œuvre du prototype- Rigueur et autonomie dans votre conduite technique du stage.- Pédagogie dans la présentation et l'explication des résultats du stage.- Vous seriez motivés par un engagement professionnel à long-terme autour de la neurologie, de la neuroimagerie, de l’anatomie computationnelle, du développement logiciel et des technologies informatiques de diagnostic médical.


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