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Détail de l'offre: 3D surface extraction from DICOM images


  • Société: Dassault Systemes
  • Secteur d'Activité: Informatique, Electronique et Télécom
  • Région du poste: France: Ile de France
  • Type de poste: 3D surface extraction from DICOM images
  • Contrat: Sans Précision
  • Formation:
  • Lieu de travail: Paris
  • Date d'embauche: NC
  • Salaire: N/A
  • Référence: NC


Description du Poste:

Team Introduction and Overview : Dassault Systèmes, « The 3DEXPERIENCE Company », offre aux entreprises et aux particuliers les univers virtuels nécessaires à la conception d’innovations durables. Ses solutions leaders sur le marché transforment pour ses clients, la conception, la fabrication et la maintenance de leurs produits. Les solutions collaboratives de Dassault Systèmes permettent de promouvoir l’innovation sociale et offrent de nouvelles possibilités d’améliorer le monde  réel grâce aux univers virtuels. Avec des ventes dans plus de 140 pays, le Groupe apporte de la valeur à plus de 190 000 entreprises de toutes tailles dans toutes les industries. Pour plus d’informations : www.3ds.com.L'organisation 'BioSphere Research' de Dassault Systèmes réalise une veille scientifique et technologique permanente et réalise des prototypes logiciels pour évaluer l'applicabilité de nouvelles technologies et ou connaissances scientifiques.Ce service doit assurer à tout moment un haut niveau de compétences dans tous les domaines technologiques, biologiques et biomédicaux de l'entreprise, et doit préparer ses éventuelles diversifications et acquisitions. Role and Purpose : Les images issues des appareils d’IRM (Imagerie par résonance magnétique) sont des images volumiques qui donnent des indications sur les différents tissus, organes ou sous-organes par des représentations en niveaux de gris. Pour certaines analyses plus fines ou pour de l’impression 3D, il peut être utile de segmenter ces images pour reconstruire les surfaces qui limitent les tissus, organes, ou sous-organes. Par exemple, obtenir la surface d’un tibia pour une fabrication de prothèse de hanche, ou obtenir la surface d’un cerveau pour comparer l’évolution de certaines aires fonctionnelles au cours du temps.Dans le cadre de ce stage, le stagiaire recensera les algorithmes existants de segmentation d’images IRM 3D, avec un accent particulier sur les images cérébrales. Puis le stagiaire réalisera l’implémentation logicielle d’un ou plusieurs de ces algorithmes, sur architecture classique (PC) ou sur carte graphique (GP-GPU). Enfin, le composant résultant de ce développement logiciel sera intégré à une infrastructure de workflow existante, de manière à alimenter l’analyse de surface située en aval.Références:Dale, A.M., Fischl, B., Sereno, M.I., 1999. Cortical surface-based analysis. I. Segmentation and surface reconstruction. Neuroimage 9, 179-194.MacDonald, D., Kabani, N., Avis, D., & Evans, A. C. (2000). Automated 3-D extraction of inner and outer surfaces of cerebral cortex from MRI. NeuroImage, 12(3), 340-356. Technical Competencies needed : Etudiant(e) en Ecole d'Ingénieurs et/ou Master universitaire, vous préparez un diplôme de niveau Bac+5.Vous vous spécialisez en Développement Logiciel et/ou Traitement d’images 3D et/ou Analyse mathématique et géométrique et/ou Neuroanatomie Computationnelle.Compétences techniques requisesBon niveau de programmation Python ou C/C++Modélisation géométrique 3D (Mesh)Connaissances en traitement d’images médicales, formats IRM...Compétences techniques souhaitéesVotre candidature aura un atout supplémentaire, si vous disposez de :- Exposition antérieure au logiciel Freesurfer.- Exposition antérieure à des algorithmes d’extraction de surfaces.- Familiarité avec la programmation Web, en particulier WebGL.- Notions de programmation sur GPU (CUDA, OpenCL…) Personal Competencies needed : - Créativité et esprit collaboratif dans l’échange d’idées avec les autres membres du département BioSphere Research.- Autonomie et force de propositions pour la mise en œuvre du prototype- Rigueur et autonomie dans votre conduite technique du stage.- Pédagogie dans la présentation et l'explication des résultats du stage.- Vous seriez motivés par un engagement professionnel à long-terme autour de la neurologie, de la neuroimagerie, de l’anatomie computationnelle, du développement logiciel et des technologies informatiques de diagnostic médical.


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